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博士生导师简介

 

楼向阳

专业学科:作物遗传育种

研究方向:分子育种

 

楼向阳,男,博士,中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室研究员、博士生导师。

教育背景

1983年9月至1985年7月 浙江大学 农学

1993年7月至1993年 12月 浙江大学 遗传育种 硕士

1994年1月至1997年 12月 浙江大学 遗传育种 博士

2002年1月至2004年8月 美国佛罗里达大学 博士后

2004年9月至2005年8月 美国德克萨斯大学健康科学研究中心 博士后

工作经历

1997年至2003年 浙江大学 农学系 讲师

2005年至2009年 美国弗吉尼亚大学 精神病学和神经科学系 助理教授

2009年至2015年 美国阿拉巴马大学 生物统计系 副教授

2015年至2016年 美国杜兰大学 生物统计和生物信息学系 副教授

2017年至今 中国水稻研究所 水稻生物学国家重点实验室 研究员

研究方向

本人主要从事统计遗传学、生物信息学、生物大数据分析、作物遗传育种和人类疾病遗传等领域的教学和科研工作,系统地开展了作物遗传育种和数量遗传的理论与应用研究,提出了一系列分析复杂性状的遗传模型和分析新方法,并研制了实用的分析软件,为复杂性状遗传和杂种优势机理研究提供了有效的分析手段,推动了数量遗传学科发展。

实验室目前以水稻为模式植物,利用大数据分析方法挖掘水稻杂种优势的分子机理。主要开展三个方面的研究工作:

  1. 机器学习;

  2. 序列分析;

  3. 组学数据处理,搭建生物信息学分析平台。

学术奖励和活动

2006年 浙江省科学技术一等奖

2008年-2016年 主持多项美国NIH R01基金和美国自然科学基金(NSF)重大专项基金

代表性论文和专利

  1. Lou XY. (2017). Hidden Markov model approaches for biological studies. Biometrics & Biostatistics International Journal, 5: 00139.

  2. Xu HM; Xu LF; Hou TT; Luo LF; Chen GB; Sun XW; Lou XY. (2016). GMDR: Versatile software for detecting gene-gene and gene-environment interactions underlying complex traits, Current Genomics, 17: 396~402.

  3. Lou XY. (2015). UGMDR: a unified conceptual framework for detection of multifactor interactions underlying complex traits , Heredity, 114: 255~261.

  4. Xu HM; Jiang BB; Cao YJ; Zhang YX; Zhan XD; Shen XH; Cheng SH; Lou XY. Cao LY. (2015). Detection of epistatic and gene-environment interactions underlying three quality traits in rice using high-throughput genome-wide data, BioMed Research International, 2015: 135782.

  5. Xu HM; Kong XD; Chen F; Huang JX; Lou XY; Zhao JY. (2015). Transcriptome analysis of Brassica napus pod using RNA-Seq and identification of lipid-related candidate genes , BMC Genomics, 16: 858~858.

  6. Qi T; Jiang BB; Zhu ZH; Wei CS; Gao YM; Zhu SJ; Xu HM; Lou XY. (2014). Mixed linear model approach for mapping quantitative trait loci underlying crop seed traits, Heredity (Edinb), 113: 224~232.

  7. Chen GB; Liu NJ; Klimentidis YC; Zhu XF; Zhi DG; Wang XJ; Lou XY. (2014). A unified GMDR method for detecting gene-gene interactions in family and unrelated samples with application to nicotine dependence , Hum Genet, 133: 139~150.

  8. Lou XY; Chen GB; Yan L; Ma JZ; Mangold JE; Zhu J; Elston RC; Li MD. (2008). A Combinatorial Approach to Detecting Gene-Gene and Gene-Environment Interactions in Family Studies, American Journal of Human Genetics, 83: 457~467.

  9. Lou XY; Chen GB; Yan L; Ma JZ; Zhu J; Elston RC; Li MD. (2007). A generalized combinatorial approach for detecting gene-by-gene and gene-by-environment interactions with application to nicotine dependence, American Journal of Human Genetics, 80: 1125~1137.

  10. Lou XY; Ma, JZ; Yang, MCK; Zhu, Y; Liu, PY; Deng, HW; Elston, RC; Li, MD. (2006). Improvement of mapping accuracy by unifying linkage and association analysis, Genetics, 172: 647~661.

  11. Lou XY; Casella G; Todhunter RJ; Yang MCK; Wu R. (2005). A general statistical framework for unifying interval and linkage disequilibrium mapping: Toward high-resolution mapping of quantitative traits. Journal of the American Statistical Association, 100: 158~171.

  12. Wu RL#, Lou XY#, Ma CX#, Wang XL, Larkins BA, Casella G. (2002). An improved genetic model generates high-resolution mapping of QTL for protein quality in maize endosperm. Proc Natl Acad Sci U S A., 99: 11281~11286 (first co-author).

  1. 徐海明; 祁婷; 曹玉杰; 祝水金; 楼向阳,一种基于混合线性模型的种子数量性状位点定位方法, 2013.11.07, 中国, ZL201310549029.0 (发明专利)

  2. 朱志翔; 童晓然; 朱智宏; 楼向阳; 陈国波; 朱军, 广义多因素维度缩减算法图形处理器实现软件[简称:GMDR-GPU] V1.0, 2012SR014341, 原始取得, 全部权利, 2012.02.15 (软件著作权)

 

通讯地址:浙江省杭州市体育场路359号 中国水稻研究所 310006

电  话:0571-63370265

电子邮箱:xylou@uab.edu


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内容更新日期:2018-09-30